大学における産学連携活動、兼業活動等全体の活動を対象に実施されるCOI医学研究分野のみならず、すべての研究分野を対象に各大学がマネジメント対象としています。 大学の活動内容等（医学研究機関か、人を対象とする臨床研究を実施する機関か）によって必要なCOIマネジメント場面は異なりますので、大学の性質、実施する研究活動等に従って、マネジメントを実施する場面を決定する必要があります。

個々の教職員の大学における活動全体についてのCOIマネジメントは、活動全体について、利益相反、責務相反による弊害発生のおそれがないかの確認を行い、申告した教職員自身、当該教職員の研究教育活動、さらには大学自体の信頼獲得に寄与するものです。 研究への企業の関与や経済的利益の存在そのものが問題視されている訳ではありません。

職員等が行う産学連携活動等に係るCOIマネジメントを目的とするため、企業等との産学連携活動等の実施、企業等からの一定額以上の金銭の供与、取得している株式、企業等から提供される物品や施設やサービス（役務）、その他マネジメント委員会が、COIマネジメントの対象として認める行為。自己申告対象となる活動の範囲としては、一年度毎の活動を対象とし、年度のはじめに、当該年度に予定されている活動が対象となります。この点、一部の大学では、すでに終了した活動を対象としている機関もあるようです。事後報告による管理については、終了した活動などについて事後的にCOI状況を把握するという意味では有用ではありますが、COIによる弊害発生を未然に防止するという趣旨からは管理が行えず、不足があると言わざるを得ません。 この点、東京医科歯科大学では、毎年５月に、当該年度に実施した（4〜5月の間で）、あるいは実施する予定の活動について、自己申告を依頼し、その後新たに申告すべき事象が発生した場合には随時自己申告をする体制を採っています。 なお、自己申告の基準の具体的な基準については、現在利益相反マネジメントについては、厚生労働科学研究における利益相反（Conflict of Interest：COI）の管理に関する指針（平成20年3月31日科発第0331001号厚生科学課長決定）を筆頭に各種ルールやガイドライン等が存在しますが、自己申告の基準については、大学等機関で決定することが求められています。

マネジメント事務局、マネジメント委員の負担を配慮すると共に、2)公的研究費を用いて実施する研究に関するCOI:及び3)臨床研究COI：については、実施する研究の阻害とならないように、また自己申告含め煩雑な手続によって研究者に過度な負担が及ばないように、効率的かつ明快な流れを設定する必要があります。 以下、参考までに、東京医科歯科大学におけるマネジメントの流れを紹介します。